卡內基美隆大學、匹茲堡大學和華盛頓大學的研究人員發現，受到阿茲海默症影響的大腦細胞中，DNA的三維組織出現擾動。這些發現發表在《Science》上，揭示了疾病先前未被探索的一層，可能引導至新的治療途徑。
該研究將基因組摺疊的變化與基因活性的變化以及大腦組織的組織聯繫起來。科學家們結合了單細胞技術、大腦組織空間圖譜和深度學習模型，以構建這些變化的詳細圖像。該研究重點關注參與長期失智症研究的患有和未患有阿茲海默症的個體的額葉皮質的屍檢樣本。
卡內基美隆大學計算生物學雷和斯蒂芬妮·萊恩教授暨該研究的領導和監督者簡·馬表示：「阿茲海默症不能僅僅逐層理解。」「基因組的三維結構是一個基本的調節層，有助於連接DNA序列與基因活性。通過整合基因組摺疊、細胞狀態和組織背景，我們可以超越編目與疾病相關的變化，進而了解它們如何相互配合以及接下來測試哪些機制。」
該團隊利用GAGE-seq，這是一種測量單個細胞內基因表達和三維基因組接觸的技術，並結合空間轉錄組圖譜，以保留有關大腦組織內基因活性的信息。這使研究人員能夠將基因組的物理組織與基因調節聯繫起來，並在周圍組織中確定與阿茲海默症相關的分子和細胞變化。該研究表明，DNA摺疊方式的變化會影響細胞功能，並導致阿茲海默症的發展。
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