Изследователи от Университета Карнеги Мелън, Университета в Питсбърг и Университета на Вашингтон идентифицираха нарушения в триизмерната организация на ДНК в мозъчните клетки, засегнати от болестта на Алцхаймер. Резултатите, публикувани в *Science*, разкриват досега непознат слой на заболяването, който може да доведе до нови пътища за лечение.
Изследването свърза промените в нагъването на генома с промени в генната активност и организацията на мозъчната тъкан. Учените използваха комбинация от технология за единични клетки, пространствено картографиране на мозъчната тъкан и модел за дълбоко обучение, за да създадат подробна картина на тези промени. Изследването се фокусира върху посмъртни проби от префронталния кортекс на хора с и без болестта на Алцхаймер, участвали в дългосрочно проучване на деменцията.
„Болестта на Алцхаймер не може да бъде разбрана слой по слой“, каза Джиан Ма, професор по изчислителна биология в Университета Карнеги Мелън, който ръководи и наблюдава изследването. „Триизмерната структура на генома е фундаментален регулаторен слой, който помага за свързването на последователността на ДНК с генната активност. Чрез интегриране на нагъването на генома, състоянието на клетките и контекста на тъканите, можем да надхвърлим каталогизирането на промените, свързани със заболяването, към разбиране как те се вписват заедно и кои механизми да тестваме след това.“
Екипът използва GAGE-seq, техника, измерваща както генната експресия, така и триизмерните контакти на генома в отделните клетки, заедно с пространствени транскриптомни карти, за да запази информация за генната активност в мозъчната тъкан. Това позволи на изследователите да свържат физическата организация на генома с генната регулация и да определят свързаните с Алцхаймер молекулярни и клетъчни промени в околната тъкан. Изследването предполага, че промените в начина, по който ДНК се нагъва, могат да повлияят на клетъчната функция и да допринесат за развитието на болестта на Алцхаймер.
Прочетете оригиналното отразяване
💬 Коментари
📜 Правила за коментари